72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2283 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  95.09 
 
 
265 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  61.74 
 
 
271 aa  337  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  59.85 
 
 
264 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  57.36 
 
 
265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  56.6 
 
 
265 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  57.36 
 
 
265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  57.36 
 
 
265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  56.98 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  52.83 
 
 
284 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  39.52 
 
 
271 aa  202  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  38.01 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  39.43 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  30.61 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  29.88 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  30.08 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  27.69 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  29.36 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  30.04 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  29.13 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  30.2 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  25.83 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  25.09 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  25.37 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  24.5 
 
 
286 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  25.9 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  25.2 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  24.5 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  24.49 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  24.5 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  26.54 
 
 
323 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  24.54 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  23.97 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  25.94 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  27.33 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  23.86 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  25.48 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  22.18 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  26.44 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  24.8 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  24.39 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  27.8 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  22.87 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  24.6 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  35.14 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  24.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.78 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  24.6 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  24.11 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  24.25 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  28.4 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 
286 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  24.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  24.11 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  26.8 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  24.11 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  24.37 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  25 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4143  acyl-CoA thioesterase  25.93 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  23.69 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  30.83 
 
 
339 aa  42.4  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  25.6 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0166  palmitoyl-CoA hydrolase  30.39 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00441126  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2907  acyl-CoA thioesterase  36 
 
 
309 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121085  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  24.02 
 
 
323 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>