199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2250 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  75 
 
 
264 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5217  acyl-CoA thioesterase  68.73 
 
 
272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709818  hitchhiker  0.00988837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4850  acyl-CoA thioesterase  68.34 
 
 
272 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4938  acyl-CoA thioesterase  68.34 
 
 
272 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436954  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1008  acyl-CoA thioesterase  53.82 
 
 
283 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473506  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  45.02 
 
 
277 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2592  Choloyl-CoA hydrolase  42.49 
 
 
274 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0205084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  35.82 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  36.76 
 
 
300 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  37.05 
 
 
285 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  35.83 
 
 
286 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 
299 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  37.01 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  35.43 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  34 
 
 
287 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  35.02 
 
 
291 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 
286 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 
286 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 
286 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  37.11 
 
 
301 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  34.92 
 
 
286 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
286 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  37.3 
 
 
291 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
286 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  35.14 
 
 
291 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  35.2 
 
 
291 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  37.94 
 
 
287 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  34.55 
 
 
310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  37.94 
 
 
287 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  34.72 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2001  palmitoyl-CoA hydrolase  36.11 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.657953  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  34.8 
 
 
285 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  36.65 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  33.85 
 
 
293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2248  palmitoyl-CoA hydrolase  37.41 
 
 
297 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  34.66 
 
 
294 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  33.99 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  34.89 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  30.69 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  35.16 
 
 
288 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  34.77 
 
 
306 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  37.55 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  36.76 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  36.11 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  34.36 
 
 
286 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  32.08 
 
 
287 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  36.11 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  33.47 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  35.41 
 
 
295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  36.51 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  31.87 
 
 
286 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  35.32 
 
 
289 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  34.13 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  33.6 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  33.6 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  33.6 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  32.27 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  33.45 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  34.13 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  34.13 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  35.55 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  35.06 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  31.47 
 
 
288 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  36.11 
 
 
314 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  36.25 
 
 
286 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  31.47 
 
 
288 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  32.27 
 
 
287 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  31.47 
 
 
288 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  34.26 
 
 
289 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  34.26 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  32.54 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  33.2 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  33.07 
 
 
289 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  34.9 
 
 
289 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 
277 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  34.39 
 
 
289 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 
289 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  33.86 
 
 
289 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  31.08 
 
 
288 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 
310 aa  125  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  34.77 
 
 
288 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  30.63 
 
 
289 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  33.58 
 
 
283 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  33.86 
 
 
300 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  34.39 
 
 
288 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  34.92 
 
 
289 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  30.68 
 
 
288 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  33.07 
 
 
289 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>