195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2556 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 		 287 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  84.27 
 
 		 288 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  80.77 
 
 		 286 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  82.58 
 
 		 288 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  83.8 
 
 		 288 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  80.14 
 
 		 288 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  80.14 
 
 		 288 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  79.44 
 
 		 288 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  79.44 
 
 		 288 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  79.44 
 
 		 288 aa  474  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  80.14 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  80.14 
 
 		 288 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  79.79 
 
 		 288 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  79.44 
 
 		 288 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  79.02 
 
 		 289 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  73.17 
 
 		 287 aa  431  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  63.6 
 
 		 287 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  62.68 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  62.68 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  62.68 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  62.54 
 
 		 286 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  62.54 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  62.54 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  62.54 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  62.54 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  62.54 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  62.54 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  62.54 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  62.54 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  62.19 
 
 		 286 aa  358  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  61.84 
 
 		 286 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  61.84 
 
 		 286 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  58.66 
 
 		 289 aa  355  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  61.48 
 
 		 286 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  61.48 
 
 		 286 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  61.48 
 
 		 286 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  56.64 
 
 		 289 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  55.12 
 
 		 289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  59.62 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  55.12 
 
 		 289 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  56.23 
 
 		 286 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  55.12 
 
 		 285 aa  336  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  59.92 
 
 		 287 aa  334  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  58.87 
 
 		 287 aa  334  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  57.03 
 
 		 287 aa  332  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  55.85 
 
 		 286 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  58.78 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  54.7 
 
 		 290 aa  328  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  56.27 
 
 		 286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  53.71 
 
 		 289 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  54.06 
 
 		 289 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  52.3 
 
 		 289 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  52.42 
 
 		 289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  52.04 
 
 		 289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  52.04 
 
 		 289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  52.04 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  52.13 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  52.71 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  51.24 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  51.25 
 
 		 296 aa  301  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  49.82 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  51.23 
 
 		 288 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  51.06 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  48.42 
 
 		 288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  50.18 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  47.08 
 
 		 299 aa  278  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  48.25 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  48.94 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  48.06 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01959  Acyl-CoA thioesterase II  51.6 
 
 		 288 aa  275  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000306387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  46.85 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  48.59 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  46.83 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  48.08 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  46.59 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  45.91 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  46.5 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  46.95 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  46.85 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  45.71 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  49.12 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  46.59 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  44.37 
 
 		 310 aa  262  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  45.45 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  45.39 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  47.67 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 		 314 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  45.83 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  44.98 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  44.48 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  45.07 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  45.42 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  44.72 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  44.01 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  44.1 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  44.01 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  44.01 
 
 		 291 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  43.16 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  46.53 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  45.23 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>