190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2592 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2592  Choloyl-CoA hydrolase  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0205084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4196  acyl-CoA thioesterase  68.09 
 
 
324 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  42.36 
 
 
314 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  43.48 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  42.6 
 
 
310 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  44.98 
 
 
277 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  42.61 
 
 
293 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  43.43 
 
 
277 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  42.75 
 
 
291 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  43.66 
 
 
287 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  43.73 
 
 
288 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  43.31 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  42.2 
 
 
292 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  36.97 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  42.76 
 
 
295 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  38.6 
 
 
296 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  40.29 
 
 
285 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  40.43 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  42.24 
 
 
294 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  42.03 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  38.75 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  38.65 
 
 
300 aa  178  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  41.3 
 
 
289 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  42.12 
 
 
314 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  39.85 
 
 
288 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  38.18 
 
 
288 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  38.18 
 
 
288 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  38.18 
 
 
288 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  38.01 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  39.85 
 
 
288 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  39.85 
 
 
288 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  38.18 
 
 
288 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  38.21 
 
 
282 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  39.26 
 
 
286 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  38.6 
 
 
291 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  38.93 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  38.15 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  38.93 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  39.58 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 
311 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  36.86 
 
 
287 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  38.93 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2249  acyl-CoA thioesterase II  38.69 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2296  acyl-CoA thioesterase II  38.69 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2288  acyl-CoA thioesterase II  38.69 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  39.11 
 
 
288 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  37.82 
 
 
282 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 
286 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  39.78 
 
 
281 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  37.46 
 
 
294 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  39.29 
 
 
300 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  37.64 
 
 
286 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  39.08 
 
 
286 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  40 
 
 
288 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  37.64 
 
 
286 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  36.88 
 
 
291 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
288 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  39.62 
 
 
268 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  36.69 
 
 
285 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  42.31 
 
 
293 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  37.14 
 
 
291 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  40.23 
 
 
274 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  39.93 
 
 
290 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  37.78 
 
 
287 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  37.77 
 
 
289 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  37.14 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  37.14 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  41.79 
 
 
314 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  38.74 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  41.96 
 
 
285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  39.63 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  38.34 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  36.72 
 
 
286 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  36.46 
 
 
288 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  37.73 
 
 
286 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  38.55 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  35.59 
 
 
284 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  38.04 
 
 
310 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  40.78 
 
 
283 aa  162  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  38.18 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  36.5 
 
 
286 aa  161  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  38.13 
 
 
289 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  39.68 
 
 
318 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  38.95 
 
 
299 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>