195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1270 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  100 
 
 
277 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
300 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  44.52 
 
 
311 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  43.62 
 
 
300 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  43.49 
 
 
296 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  44.89 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  44.83 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  44.83 
 
 
306 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  44.78 
 
 
299 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  43.29 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  45.1 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  44.56 
 
 
294 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 
301 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  43.27 
 
 
291 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  42.11 
 
 
318 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  44.13 
 
 
293 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  44.57 
 
 
292 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  43.64 
 
 
286 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
294 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  42.55 
 
 
300 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  40.48 
 
 
310 aa  192  7e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  42.29 
 
 
314 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  44.4 
 
 
289 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  42.91 
 
 
291 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  42.01 
 
 
288 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4850  acyl-CoA thioesterase  47.49 
 
 
272 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4938  acyl-CoA thioesterase  47.49 
 
 
272 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436954  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5217  acyl-CoA thioesterase  47.49 
 
 
272 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709818  hitchhiker  0.00988837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  42.55 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  42.75 
 
 
288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  43.53 
 
 
287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  43.64 
 
 
292 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  43.17 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2592  Choloyl-CoA hydrolase  48.72 
 
 
274 aa  188  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0205084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  40.34 
 
 
326 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  42.18 
 
 
293 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  47.23 
 
 
264 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  39.26 
 
 
287 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  43.6 
 
 
294 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  41.81 
 
 
294 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  41.67 
 
 
285 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  42.34 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  41.22 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  40.86 
 
 
283 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  39.26 
 
 
286 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  39.26 
 
 
286 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  38.89 
 
 
286 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  43.48 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  39.26 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  39.26 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  39.26 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  42.55 
 
 
310 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  38.81 
 
 
286 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  42.09 
 
 
295 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  38.81 
 
 
286 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  41.79 
 
 
286 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  38.81 
 
 
286 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  40.49 
 
 
301 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  41.67 
 
 
289 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  45.02 
 
 
264 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 
283 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  43.8 
 
 
294 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  38.38 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  37.68 
 
 
287 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  39.21 
 
 
289 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  41.07 
 
 
290 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  38.59 
 
 
299 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  40.65 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  39.86 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  37.17 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  38.85 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  40.36 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  40.29 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1008  acyl-CoA thioesterase  43.12 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473506  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  45.63 
 
 
339 aa  172  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  41.28 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  39.18 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  38.13 
 
 
285 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  41.48 
 
 
289 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  37.22 
 
 
286 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  40.74 
 
 
289 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  38.17 
 
 
287 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  40.58 
 
 
281 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  38.69 
 
 
282 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  39.59 
 
 
300 aa  168  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  39.34 
 
 
288 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  39.34 
 
 
288 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  40.74 
 
 
289 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  40.15 
 
 
289 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  38.43 
 
 
281 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  37.59 
 
 
287 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  39.72 
 
 
296 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>