196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4938 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4850  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4938  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5217  acyl-CoA thioesterase  99.26 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709818  hitchhiker  0.00988837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  68.34 
 
 		 264 aa  345  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  65.5 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1008  acyl-CoA thioesterase  55.47 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473506  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  47.49 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  40.61 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2592  Choloyl-CoA hydrolase  42.17 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0205084  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  38.29 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  40.61 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  38.41 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  36.69 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  37.07 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  39.53 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  37.31 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  37.8 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  39 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  37.35 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  36.65 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  37.6 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  34.58 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  34.98 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  36.22 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  36.08 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  36.3 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  37.8 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  37.65 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  36 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  36.76 
 
 		 311 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  37.65 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  37.65 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  36.23 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  36.3 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  37.2 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  38.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  35.74 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  36.25 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  36.22 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  36.76 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  34.78 
 
 		 289 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  34.52 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  37.01 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  38.25 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  34.52 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  37.11 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  35.83 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2249  acyl-CoA thioesterase II  36.65 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2296  acyl-CoA thioesterase II  36.65 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2288  acyl-CoA thioesterase II  36.65 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  36.22 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  35.57 
 
 		 300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  36.72 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  35.66 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  34.96 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  37.85 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1512  palmitoyl-CoA hydrolase  36.75 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000784091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  36.61 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  37.4 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  37.08 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  33.98 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  38.19 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  35.46 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  36.08 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  36.78 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  37.45 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  37.4 
 
 		 289 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  35.32 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  35.43 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  35.18 
 
 		 288 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  34.11 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  32.94 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  34.11 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  35.29 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  34.11 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  33.99 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  32.54 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  34.62 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  33.73 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>