196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2297 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 284 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  62.36 
 
 		 274 aa  328  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  60.29 
 
 		 282 aa  318  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  59.06 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  58.55 
 
 		 281 aa  301  9e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2249  acyl-CoA thioesterase II  59.35 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2296  acyl-CoA thioesterase II  59.35 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2288  acyl-CoA thioesterase II  59.35 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  52.52 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  47.5 
 
 		 294 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  47.35 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  48.21 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  47.83 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  47.65 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  49.45 
 
 		 301 aa  234  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  49.82 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  45.96 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  45.96 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  48.03 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  46.32 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  45 
 
 		 294 aa  225  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  44.29 
 
 		 293 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  44.84 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  47.29 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  48.01 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  44.48 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  43.9 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  43.9 
 
 		 291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  43.88 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  47.33 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  43.51 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  47.08 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  43.32 
 
 		 285 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  48.38 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  44.13 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  46.62 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  43.01 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  44.13 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  43.42 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  48.15 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  43.53 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  47.45 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  43.8 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  44.69 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  44.53 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  45.71 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  44.24 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  46.35 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  43.77 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  43.36 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  44.57 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  42.5 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  44.41 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 		 289 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  44.13 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  44.48 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  46.52 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  41.33 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  41.33 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  41.33 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  43.23 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  42.11 
 
 		 292 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  41.44 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  40.15 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  40.3 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  40 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  44.21 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  41.28 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  41.96 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1512  palmitoyl-CoA hydrolase  44.96 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000784091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  39.93 
 
 		 287 aa  191  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  40.3 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  39.57 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  39.29 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  39.63 
 
 		 287 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  43.8 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  39.77 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  40.78 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  40.3 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  39.56 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  40.64 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  38.41 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  39.63 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  43.06 
 
 		 293 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  39.63 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  39.63 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  39.26 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  38.01 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  40.51 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  38.38 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>