189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2296 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2249  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 		 281 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2296  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 		 281 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2288  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 		 281 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  85 
 
 		 282 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  84.4 
 
 		 282 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  81.39 
 
 		 281 aa  471  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  59.35 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  57.66 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  53.05 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  52.73 
 
 		 310 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  51.28 
 
 		 301 aa  248  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  49.46 
 
 		 277 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  48.93 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  49.64 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  48.93 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  47.54 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  47.54 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  47.54 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  47.31 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  46.69 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  46.67 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  48.03 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  47.27 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  46.91 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  46.67 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  47.67 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  47.55 
 
 		 293 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  46.57 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  47.67 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  48.55 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  47.67 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  46.81 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  46.26 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  47 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  47.83 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  47.29 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  48.91 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  45.77 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  50.39 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  45.52 
 
 		 285 aa  221  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  46.59 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  45.73 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  46.72 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  46.64 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  45.23 
 
 		 289 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  49.28 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  46.04 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  46.04 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  44.77 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  46.48 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  42.81 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  47.65 
 
 		 294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  45.55 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  44.48 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  44.96 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  43.77 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  43.77 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  42.56 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1512  palmitoyl-CoA hydrolase  48.23 
 
 		 285 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000784091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  45.94 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  43.68 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  46.35 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  45.13 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  45.42 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  44.29 
 
 		 288 aa  201  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  40.91 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  45.26 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  41.05 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  44.27 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  43.01 
 
 		 285 aa  198  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  42.2 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  43.12 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  43.12 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  46 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  43.12 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  43.12 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  43.12 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  43.12 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  42.75 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  40.71 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  40.81 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  41.52 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  43.12 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  41.52 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  41.52 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  40.88 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  39.64 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  42.09 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  39.64 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  39.64 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  44.36 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  39.64 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  39.64 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  39.64 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  39.64 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  39.64 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  39.64 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  41.37 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>