194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2417 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  100 
 
 
326 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  84 
 
 
326 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  61.9 
 
 
339 aa  345  8e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  60.63 
 
 
314 aa  335  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  56.95 
 
 
292 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  58.1 
 
 
285 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  56.25 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  56.34 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11520  acyl-CoA thioesterase  49.67 
 
 
311 aa  289  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  53.79 
 
 
323 aa  288  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1097  acyl-CoA thioesterase  49.32 
 
 
300 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.157874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  48.99 
 
 
301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  51.53 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  50.35 
 
 
314 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  48.79 
 
 
300 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  48.78 
 
 
294 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  48.43 
 
 
294 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  49.13 
 
 
311 aa  262  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  48.98 
 
 
300 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  46.9 
 
 
294 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1854  acyl-CoA thioesterase  44.78 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  47.24 
 
 
303 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  47.92 
 
 
288 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 
287 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  45.67 
 
 
296 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  47.9 
 
 
293 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
289 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  48.48 
 
 
314 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  46.49 
 
 
286 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  46.49 
 
 
286 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  46.49 
 
 
286 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  45.77 
 
 
294 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  49.64 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  45.96 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  44.52 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  47.39 
 
 
294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  50.35 
 
 
277 aa  242  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  45.21 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  45.02 
 
 
288 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  46.03 
 
 
291 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 
301 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  44.6 
 
 
293 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  45.86 
 
 
288 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  45.86 
 
 
288 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  45.86 
 
 
288 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  45.86 
 
 
288 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  45.86 
 
 
288 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  44.6 
 
 
291 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  45.86 
 
 
288 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  45.83 
 
 
287 aa  235  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  44.52 
 
 
291 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  44.98 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  45.49 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  45.83 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  45.33 
 
 
292 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  47.06 
 
 
290 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  45.11 
 
 
288 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  43.3 
 
 
291 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  47.95 
 
 
295 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  43.94 
 
 
291 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  46.42 
 
 
287 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  44.61 
 
 
289 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  45.14 
 
 
287 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  45.52 
 
 
289 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  44.03 
 
 
288 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  45.24 
 
 
289 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  43.17 
 
 
288 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  43.23 
 
 
287 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  44.44 
 
 
286 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  41.22 
 
 
289 aa  228  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
288 aa  228  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  46.04 
 
 
287 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  46.43 
 
 
283 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  44.36 
 
 
288 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  42.8 
 
 
286 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  43.54 
 
 
286 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  40.28 
 
 
292 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  44.28 
 
 
286 aa  225  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  44.33 
 
 
289 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  42.27 
 
 
318 aa  225  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  43.54 
 
 
286 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  43.33 
 
 
286 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  46.32 
 
 
289 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  44.36 
 
 
287 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  44.06 
 
 
305 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0306  acyl-CoA thioesterase  40.2 
 
 
319 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  43.33 
 
 
286 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  45.28 
 
 
287 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  43.17 
 
 
286 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  45.24 
 
 
292 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  41.96 
 
 
285 aa  222  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>