191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2851 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  100 
 
 
288 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  60.22 
 
 
296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
301 aa  262  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  52.33 
 
 
310 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  50 
 
 
277 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  50.35 
 
 
293 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  48.55 
 
 
282 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  48.07 
 
 
296 aa  245  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  48.61 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  47.92 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
289 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  48.6 
 
 
299 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  45.95 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  48.76 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  49.46 
 
 
281 aa  241  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  45.48 
 
 
300 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  46.81 
 
 
295 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  47.46 
 
 
282 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  45.76 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  47.54 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  46.6 
 
 
291 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2249  acyl-CoA thioesterase II  48.93 
 
 
281 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2296  acyl-CoA thioesterase II  48.93 
 
 
281 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2288  acyl-CoA thioesterase II  48.93 
 
 
281 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  45.08 
 
 
293 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  45.61 
 
 
291 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  47.83 
 
 
284 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  43.45 
 
 
294 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  47.26 
 
 
314 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  44.95 
 
 
285 aa  235  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  42.76 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  47.87 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  47.52 
 
 
294 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  47.14 
 
 
291 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  44.75 
 
 
291 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  45.33 
 
 
286 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  47.43 
 
 
287 aa  231  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  47.72 
 
 
274 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  43.75 
 
 
285 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  44.64 
 
 
294 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  45 
 
 
301 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  45.36 
 
 
311 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  47.65 
 
 
299 aa  225  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  46.15 
 
 
300 aa  225  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  43.46 
 
 
294 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  47.5 
 
 
306 aa  225  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  47.59 
 
 
288 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  44.93 
 
 
287 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 
288 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  44.21 
 
 
286 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  44.21 
 
 
286 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  43.77 
 
 
300 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  43.86 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  43.86 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  43.86 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  46.48 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  43.46 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  44.53 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  44.68 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  43.68 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  43.55 
 
 
326 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  43.75 
 
 
286 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  46.58 
 
 
283 aa  219  6e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  44.04 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 
286 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 
286 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 
286 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  44.48 
 
 
290 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 
286 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 
286 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  43.37 
 
 
288 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  43.37 
 
 
288 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  42.81 
 
 
286 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 
286 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  45.02 
 
 
287 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 
286 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  41.28 
 
 
287 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  44.94 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  44.28 
 
 
287 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  43.3 
 
 
289 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  43.77 
 
 
286 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  42.61 
 
 
268 aa  215  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  43.06 
 
 
289 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  43.01 
 
 
288 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 
288 aa  215  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  42.01 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  42.36 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  42.36 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  42.28 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  42.18 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  43.01 
 
 
288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  42.18 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  42.39 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  42.39 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  42.18 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  42.39 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  42.39 
 
 
288 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  46.47 
 
 
294 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>