196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5686 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  71.2 
 
 		 301 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  66.55 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  60.27 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  59.93 
 
 		 294 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  60.78 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  57.14 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  57.19 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  60.52 
 
 		 294 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  56.69 
 
 		 293 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  59.49 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  55.7 
 
 		 299 aa  299  5e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  55.16 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  58.33 
 
 		 288 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  56.94 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  55 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  54.26 
 
 		 294 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  55 
 
 		 300 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  55.36 
 
 		 300 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  52.63 
 
 		 294 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  55.52 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  44.84 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  55.52 
 
 		 287 aa  278  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  55.16 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  52.33 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  49.68 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  50.87 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  50.17 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  51.42 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  51.92 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  52.67 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  51.97 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  53.41 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  55.88 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  51.77 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  55.48 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  49.82 
 
 		 294 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  50.18 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  52.33 
 
 		 288 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  49.65 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  51.07 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  48.67 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  53.21 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  50.18 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  51.38 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  49.47 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  49.82 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  49.65 
 
 		 289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  49.29 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  48.76 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  47.64 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  46.76 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  47.64 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  47.64 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  51.14 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  47.79 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  48.79 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  49.29 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  47.46 
 
 		 286 aa  245  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  47.46 
 
 		 288 aa  245  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  52 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  47.27 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  48.44 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  47.27 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  51.45 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  47.27 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  47.43 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  47.41 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  45.91 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  47.7 
 
 		 268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  47.27 
 
 		 288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  45.77 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  47.41 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  46.69 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  47.41 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  46.69 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  46.91 
 
 		 288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  49.65 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  45.1 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  46.32 
 
 		 286 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  46.32 
 
 		 286 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  46.32 
 
 		 286 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  46.32 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  47.43 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  49.06 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  49.3 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  47.79 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  47.43 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  44.6 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>