196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3540 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  58.1 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  57.39 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  59.7 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  57.58 
 
 		 292 aa  292  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  52.69 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  56.27 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  52.86 
 
 		 339 aa  261  8.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1097  acyl-CoA thioesterase  52.1 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.157874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11520  acyl-CoA thioesterase  49.44 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  50.4 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  51.76 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  51.14 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  48.04 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  52.19 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  48.58 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  50.75 
 
 		 294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  50.79 
 
 		 289 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  48.16 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  47.45 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  44.75 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  44.75 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  45.39 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  44.75 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  45.3 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  46.5 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  49.63 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  44.44 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  49.47 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  45.04 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  49.12 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  48.81 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  47.16 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  44.98 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  45.23 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  46.45 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  42.32 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  45.74 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  45.58 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  42.97 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  46.15 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  45.58 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  46.15 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  43.7 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  44.33 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  44.57 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  48.02 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  43.82 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  45.49 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  43.14 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  44.05 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  44.05 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  46.6 
 
 		 314 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  45.28 
 
 		 287 aa  215  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  44.88 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  47.72 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  47.2 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  44.05 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  42.91 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  48.03 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  43.65 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  43.9 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  45.8 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  45.83 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  43.8 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  42.86 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  42.46 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  42.46 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  43.84 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  42.46 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  42.46 
 
 		 288 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  42.86 
 
 		 288 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  46.83 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  44.22 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  41.73 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1854  acyl-CoA thioesterase  45.35 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  41.57 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  42.06 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  44.6 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  41.02 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  46.45 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  43.51 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  43.41 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  41.57 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  45.49 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  45.45 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  43.65 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  44.88 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  41.13 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  44.31 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>