197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
323 aa  659    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  53.79 
 
 
326 aa  288  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  54.36 
 
 
292 aa  286  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  51.38 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  50.78 
 
 
314 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
339 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  49.13 
 
 
288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  51.76 
 
 
285 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  47.77 
 
 
323 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  47.06 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  45.91 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  44.48 
 
 
301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11520  acyl-CoA thioesterase  43.09 
 
 
311 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  44.82 
 
 
294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  40 
 
 
292 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  46.81 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  47.16 
 
 
294 aa  233  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  45.58 
 
 
294 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1097  acyl-CoA thioesterase  46.78 
 
 
300 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.157874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  44.88 
 
 
294 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  44.88 
 
 
291 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  43.36 
 
 
291 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  43.42 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  44.52 
 
 
291 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  44.67 
 
 
300 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  43.26 
 
 
314 aa  225  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  43.54 
 
 
300 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  43.62 
 
 
293 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  44.76 
 
 
311 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  44.72 
 
 
288 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  43.97 
 
 
286 aa  222  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  44.76 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  44.33 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  42.46 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  45.96 
 
 
289 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  42.91 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  44.72 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  42.61 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  44.73 
 
 
288 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  42.86 
 
 
303 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  40.77 
 
 
285 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  42.46 
 
 
286 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  42.55 
 
 
285 aa  208  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  41.81 
 
 
292 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  40.55 
 
 
305 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  44.89 
 
 
294 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  43.86 
 
 
277 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  41.96 
 
 
287 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0306  acyl-CoA thioesterase  43.58 
 
 
319 aa  205  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  42.76 
 
 
299 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  41.26 
 
 
287 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  42.01 
 
 
287 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 
288 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3041  acyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
287 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3100  acyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
287 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180741  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3057  acyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
287 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  41.26 
 
 
288 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  40.69 
 
 
289 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  42.01 
 
 
288 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  41.05 
 
 
292 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  42.01 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  42.01 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  41.76 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  40.07 
 
 
287 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  41.26 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2489  Choloyl-CoA hydrolase  37.32 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  41.04 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  38.08 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  40.07 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  44.52 
 
 
314 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  41.33 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  41.33 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  41.33 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  41.64 
 
 
288 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  41.64 
 
 
288 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  41.64 
 
 
288 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  42.18 
 
 
286 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  42.59 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  42.59 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  42.59 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  42.59 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  40.89 
 
 
288 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  41.75 
 
 
293 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  42.59 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  42.59 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  40.81 
 
 
286 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  42.59 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  42.59 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  42.22 
 
 
286 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11634  acyl-CoA thioesterase II tesB1  37.76 
 
 
300 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.186026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  41.26 
 
 
288 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  46.55 
 
 
293 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  41.26 
 
 
288 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  41.28 
 
 
300 aa  192  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  41.11 
 
 
284 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  42.01 
 
 
295 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  41.26 
 
 
287 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  39.79 
 
 
289 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  39.44 
 
 
268 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  40 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>