188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2489 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2489  Choloyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11634  acyl-CoA thioesterase II tesB1  52.08 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.186026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3041  acyl-CoA thioesterase  51.92 
 
 		 287 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3100  acyl-CoA thioesterase  51.92 
 
 		 287 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3057  acyl-CoA thioesterase  51.92 
 
 		 287 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  47.6 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3590  acyl-CoA thioesterase  49.47 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0111509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2825  acyl-CoA thioesterase  51.57 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  38.87 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  39.15 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  36.65 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  36.3 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  36.17 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  37.32 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  36.86 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  37.5 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  35.97 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  35.37 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  34.56 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  35.37 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  38.1 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  34.24 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  34.35 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  35.03 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  39.46 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  39.46 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  34.15 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  34.35 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  39.08 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  35.03 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  36.84 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  36.55 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11520  acyl-CoA thioesterase  34.65 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  36.08 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  36.21 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  35.19 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  35.97 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  36.01 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  36.63 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  33.9 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  32.63 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  33.45 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  34.48 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  37.69 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  37.71 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  31.96 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  32.98 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  33.45 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  34.51 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  35.63 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  34.51 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  35.63 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  35.63 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  33 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  36.26 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  33.22 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  36.33 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  34.89 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  35.63 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  35.25 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  34.55 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 288 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 288 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 288 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  31.88 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  37.74 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  35.94 
 
 		 287 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  35.88 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  36.43 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  34.34 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  35.41 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  36.4 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 		 339 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  33.21 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  35.02 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  32.47 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  31.12 
 
 		 288 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  36.82 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1035  palmitoyl-CoA hydrolase  35.5 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  32.4 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  35.66 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3009  acyl-CoA thioesterase  31.45 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  35.02 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  32.95 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  34.02 
 
 		 301 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  34.48 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  34.48 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>