190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1035 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1035  palmitoyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  45.49 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  47.47 
 
 		 310 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  41.72 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  45.1 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  40.48 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  45.67 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  45.26 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  45.08 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  44.7 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  43.14 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  44.31 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  42.42 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  42.18 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  42.65 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  42.44 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  42.47 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  41.96 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  41.18 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  40.53 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  44.15 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  41.18 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  42.59 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  42.97 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  41.89 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  42.21 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  39.22 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  44.14 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  39.23 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  38.89 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  42.25 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  39.61 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  42.25 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  42.31 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  42.25 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  41.54 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  42.29 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  42.64 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  40.31 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  40.31 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  41.15 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  41.15 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  40.68 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  41.15 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  39.92 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  41.31 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  40.08 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  40.77 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  41.09 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  40.38 
 
 		 289 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  41.02 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  42.69 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  40.77 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  37.25 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  37.21 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3041  acyl-CoA thioesterase  36.43 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3100  acyl-CoA thioesterase  36.43 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3057  acyl-CoA thioesterase  36.43 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  43.58 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  41.63 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  37.88 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 		 286 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 		 286 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 		 286 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 		 286 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 		 286 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 		 286 aa  169  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  38.52 
 
 		 286 aa  169  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  38.52 
 
 		 286 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  39.56 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  40.15 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  38.4 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  38.13 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  38.37 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  40.38 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  39.18 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  37.7 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  41.47 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  37.93 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  37.35 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  39.84 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  36.12 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  36.43 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  39.69 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  43.63 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  39.53 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  37.98 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  38.13 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  38.13 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  38.13 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  35.61 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  38.13 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  38.66 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  36.73 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  39.13 
 
 		 281 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3590  acyl-CoA thioesterase  36.61 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0111509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  37.74 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>