190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1443 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 318 aa  649    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  50.57 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  43.14 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  42.27 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  47.83 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  47.47 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  47.43 
 
 		 289 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  43.64 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  40.61 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  43.71 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  46.69 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  41.32 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  40.56 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  44.62 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  44.62 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  40.32 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  47.24 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  39.93 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  44.22 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  47.43 
 
 		 287 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  44.23 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  41.3 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  39.93 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  46.85 
 
 		 292 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  41.63 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  47.45 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  41.1 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  41.11 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  42.75 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  41.1 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  40.35 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  41.98 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  40.91 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  41.67 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  44.75 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  43.48 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  42.71 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  42.06 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  41.67 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  40.08 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  42.7 
 
 		 285 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  42.06 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  41.67 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  42.29 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  39.76 
 
 		 286 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  44.36 
 
 		 288 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  39.76 
 
 		 286 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  41.67 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  42.86 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  36.52 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  39.76 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  36.73 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2001  palmitoyl-CoA hydrolase  41.79 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.657953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  43.31 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  40.21 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  42.11 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  41.18 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  43.31 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  41.32 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  41.28 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  43.6 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  45.31 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  44.77 
 
 		 314 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  40.07 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  43.94 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  40.97 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2248  palmitoyl-CoA hydrolase  45.28 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  40.07 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  42.06 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  40.87 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  40.87 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  43.92 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  40.87 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  40.87 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  40.64 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  40.87 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  40.08 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  40.32 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  41.11 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  42.51 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  40.87 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  39.38 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  42.31 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  43.53 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  41.67 
 
 		 291 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  39.38 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  39.69 
 
 		 286 aa  188  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  40.08 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  39.13 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  40.48 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  41 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  41.84 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  39.92 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  39.15 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  39.15 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  39.15 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  39.15 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  39.15 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  39.15 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>