191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1862 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  63.35 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  60.21 
 
 		 294 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  62.59 
 
 		 289 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  57.44 
 
 		 294 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  59.01 
 
 		 288 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  56.75 
 
 		 294 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  60.78 
 
 		 287 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  59.52 
 
 		 299 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  59.72 
 
 		 287 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  55.45 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  59.23 
 
 		 292 aa  338  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  56.69 
 
 		 291 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  55.1 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  57.6 
 
 		 296 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  54.76 
 
 		 300 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  56.14 
 
 		 300 aa  332  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  55.28 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  56.49 
 
 		 294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  54.93 
 
 		 286 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  53.87 
 
 		 293 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  54.51 
 
 		 291 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  53.52 
 
 		 291 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  57.63 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  53.21 
 
 		 281 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  51.48 
 
 		 301 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  51.06 
 
 		 289 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  56.14 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  53.87 
 
 		 290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  48.21 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  49.65 
 
 		 289 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  51.25 
 
 		 286 aa  285  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  49.65 
 
 		 285 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  50.35 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  52.4 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  48.94 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  52.28 
 
 		 314 aa  281  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  48.24 
 
 		 289 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  51.66 
 
 		 289 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  50.19 
 
 		 286 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  51.29 
 
 		 289 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  48.94 
 
 		 289 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  50.19 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  50.19 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  48.94 
 
 		 289 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  51.29 
 
 		 289 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  51.89 
 
 		 287 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  52.3 
 
 		 294 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  48.2 
 
 		 286 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  51.03 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  53.47 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  51.91 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  50.71 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  51.14 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  50.35 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  48.7 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  48.7 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  48.7 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  53.55 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  48.33 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  48.33 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  52.67 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  50.38 
 
 		 286 aa  269  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  47.96 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  53.15 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 286 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  50.76 
 
 		 287 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  47.18 
 
 		 289 aa  265  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  47.6 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  48.85 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  49.11 
 
 		 295 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  49.24 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  48.85 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  48.78 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  51.61 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  49.43 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  54.24 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  48.41 
 
 		 326 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  47.96 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  47.24 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  46.76 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  50 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  53.48 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  45.72 
 
 		 287 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  48.94 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  47.73 
 
 		 289 aa  248  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  45.76 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  47.21 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  47.58 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>