188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2732 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  53.21 
 
 
303 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  51.61 
 
 
293 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  49.12 
 
 
300 aa  276  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  48.94 
 
 
286 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  48.4 
 
 
291 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  52.04 
 
 
289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  47.33 
 
 
293 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  48.76 
 
 
299 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  46.26 
 
 
291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  47.72 
 
 
291 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  49.27 
 
 
287 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  46.26 
 
 
291 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  48.91 
 
 
287 aa  261  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  47.84 
 
 
292 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  45.74 
 
 
294 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  45.74 
 
 
294 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  45.04 
 
 
294 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  43.88 
 
 
296 aa  248  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  45.04 
 
 
294 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  44.88 
 
 
288 aa  245  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  45.36 
 
 
300 aa  244  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  44.29 
 
 
311 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  44.21 
 
 
300 aa  238  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  44.48 
 
 
289 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  43.77 
 
 
286 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  43.42 
 
 
289 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  42.35 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  45.76 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  45.76 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  39.57 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  44.68 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  45.39 
 
 
289 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  45.62 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  42.5 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  41.99 
 
 
289 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  43.01 
 
 
300 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  46.64 
 
 
288 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  44.65 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  41.28 
 
 
289 aa  214  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  42.35 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  42.81 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  41.94 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  42.46 
 
 
326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  42.7 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  40.07 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  41.37 
 
 
286 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  39.5 
 
 
285 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  39.85 
 
 
287 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  44.09 
 
 
306 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  38.75 
 
 
287 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  40.15 
 
 
288 aa  208  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  39.78 
 
 
288 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  39.78 
 
 
288 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  39.78 
 
 
288 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  40.15 
 
 
288 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  40.15 
 
 
288 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  40.07 
 
 
286 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  43.59 
 
 
288 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  39.78 
 
 
288 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  42.61 
 
 
314 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  40.07 
 
 
286 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  40.07 
 
 
286 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  39.78 
 
 
288 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  40.15 
 
 
288 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  39.03 
 
 
288 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  44.85 
 
 
294 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  43.4 
 
 
284 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  42.61 
 
 
310 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  39.41 
 
 
288 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  40.65 
 
 
310 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  43.48 
 
 
283 aa  203  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  44.33 
 
 
299 aa  202  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  41.18 
 
 
283 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  45.32 
 
 
277 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  37.01 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  37.17 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  38.29 
 
 
286 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  40.69 
 
 
288 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  41.7 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  40.57 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  40.99 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  37.41 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  37.5 
 
 
289 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  40.5 
 
 
282 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  39.07 
 
 
284 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  39.16 
 
 
287 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  39.92 
 
 
287 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  41.2 
 
 
296 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 
286 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  40.57 
 
 
281 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>