185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3041 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3041  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3100  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180741  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3057  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3590  acyl-CoA thioesterase  74.47 
 
 
286 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0111509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2825  acyl-CoA thioesterase  77.62 
 
 
293 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11634  acyl-CoA thioesterase II tesB1  73.59 
 
 
300 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.186026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  53.55 
 
 
292 aa  328  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2489  Choloyl-CoA hydrolase  51.92 
 
 
296 aa  301  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  40.5 
 
 
301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  41.88 
 
 
314 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  40.07 
 
 
310 aa  228  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  38.93 
 
 
294 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  37.46 
 
 
294 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
323 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  40 
 
 
326 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  39.64 
 
 
326 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  39.5 
 
 
287 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  37.59 
 
 
286 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  36.88 
 
 
296 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  39.5 
 
 
287 aa  191  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  36.36 
 
 
291 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  37.86 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  40.07 
 
 
299 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  36.88 
 
 
291 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  37.76 
 
 
303 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  37.06 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  36.17 
 
 
291 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 
293 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  38.35 
 
 
285 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  37.94 
 
 
292 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  37.76 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  36.43 
 
 
293 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  34.98 
 
 
285 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  35.48 
 
 
281 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 
283 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  34.04 
 
 
291 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  35.82 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  37.98 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  37.32 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  35.54 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  34.47 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  33.68 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  35.54 
 
 
300 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  36.53 
 
 
288 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  35.36 
 
 
300 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1035  palmitoyl-CoA hydrolase  36.43 
 
 
308 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  35.23 
 
 
300 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  34.81 
 
 
289 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  36.19 
 
 
294 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  34.77 
 
 
286 aa  168  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  34.04 
 
 
294 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  38.93 
 
 
339 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11520  acyl-CoA thioesterase  35.77 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3009  acyl-CoA thioesterase  33.69 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
314 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2994  acyl-CoA thioesterase  33.21 
 
 
288 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3038  acyl-CoA thioesterase  33.21 
 
 
288 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.683464  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  32.27 
 
 
288 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  35.59 
 
 
288 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  30.04 
 
 
289 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  32.53 
 
 
290 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  33.57 
 
 
286 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  30.6 
 
 
285 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  36.3 
 
 
288 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  33.45 
 
 
305 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  34.42 
 
 
296 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  32.63 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  32.28 
 
 
286 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 
306 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  31.1 
 
 
289 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  31.34 
 
 
289 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  30.96 
 
 
289 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  31.76 
 
 
286 aa  148  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  31.45 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  34.74 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  33.45 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  31.1 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  31.56 
 
 
288 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  32.03 
 
 
286 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  32.17 
 
 
284 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  31.73 
 
 
289 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  31.14 
 
 
289 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  31.37 
 
 
289 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  31.37 
 
 
289 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  31.77 
 
 
292 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 
287 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  35.79 
 
 
293 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  32.42 
 
 
287 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  31.85 
 
 
288 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  32.73 
 
 
281 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  32.62 
 
 
318 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  31 
 
 
289 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1854  acyl-CoA thioesterase  31.91 
 
 
301 aa  142  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  31.45 
 
 
295 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  31.62 
 
 
287 aa  142  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  33.2 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  33.07 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  30.88 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  33.07 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>