188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3009 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3009  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2994  acyl-CoA thioesterase  98.59 
 
 
288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3038  acyl-CoA thioesterase  98.59 
 
 
288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.683464  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5814  acyl-CoA thioesterase  43.16 
 
 
308 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.365462  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1022  acyl-CoA thioesterase  43.11 
 
 
274 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  37.09 
 
 
301 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  35.84 
 
 
314 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  36.5 
 
 
310 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  38.18 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  37.32 
 
 
283 aa  182  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  37.59 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  37 
 
 
326 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  36.2 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  36.63 
 
 
326 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  34.78 
 
 
294 aa  171  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  37.05 
 
 
277 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  34.78 
 
 
294 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  36.3 
 
 
288 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  36.3 
 
 
288 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  37.31 
 
 
288 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  36.3 
 
 
288 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  35.93 
 
 
288 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  35.56 
 
 
288 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  32.97 
 
 
294 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  34.16 
 
 
296 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  35.96 
 
 
288 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  35.96 
 
 
288 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  35.23 
 
 
293 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  36.92 
 
 
288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  35.21 
 
 
288 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  36.55 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  35.09 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  35.82 
 
 
286 aa  165  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3041  acyl-CoA thioesterase  33.69 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  35.58 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3100  acyl-CoA thioesterase  33.69 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180741  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  37.04 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  36.07 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3057  acyl-CoA thioesterase  33.69 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  36.57 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  37.93 
 
 
292 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  36 
 
 
291 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  32.49 
 
 
294 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  35.21 
 
 
288 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  32.13 
 
 
294 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  36.33 
 
 
289 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  31.67 
 
 
285 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  33.45 
 
 
291 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  38.73 
 
 
285 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 
293 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 
291 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  32.49 
 
 
294 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  33.81 
 
 
286 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  36.43 
 
 
314 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 
291 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1035  palmitoyl-CoA hydrolase  36.36 
 
 
308 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
300 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  34.69 
 
 
282 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  32.74 
 
 
299 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  34.07 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  32.98 
 
 
285 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  34.83 
 
 
286 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  32.37 
 
 
288 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 
292 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  34.83 
 
 
286 aa  155  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  34.7 
 
 
286 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  34.32 
 
 
282 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
287 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  36.69 
 
 
299 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  35.69 
 
 
290 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  34.28 
 
 
287 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  28.47 
 
 
292 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  35.38 
 
 
289 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  31.93 
 
 
289 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  34.25 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  33.58 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  34.25 
 
 
289 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  31.21 
 
 
311 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
289 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  32.14 
 
 
281 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  34.04 
 
 
289 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  35.21 
 
 
284 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  33.58 
 
 
287 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11634  acyl-CoA thioesterase II tesB1  32.36 
 
 
300 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.186026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  33.69 
 
 
301 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  32.99 
 
 
289 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  33.21 
 
 
293 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  32.16 
 
 
291 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  35.74 
 
 
286 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  33.82 
 
 
296 aa  148  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  33.94 
 
 
300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  33.21 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  31.21 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  34.07 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2489  Choloyl-CoA hydrolase  31.45 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  34.07 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  30.85 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11520  acyl-CoA thioesterase  33.45 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  32.73 
 
 
323 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  32.86 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>