189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3210 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 293 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  51.55 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  49.29 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  45.89 
 
 		 294 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  45.86 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  46.34 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  46.76 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  48.21 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  45.55 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  45.27 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  41.26 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  43.62 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  44.98 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  45.21 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  43.39 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  41.78 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  42.96 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  40.94 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  41.72 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  43.71 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  46.34 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  42.21 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  40.69 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  42.66 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  41.38 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  39.18 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  44.25 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  42.37 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  44.15 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  42.81 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  41.75 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  44.8 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  42.37 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  44.6 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  41.55 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  40.79 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  40.56 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  41.67 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  37.89 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09760  acyl-CoA thioesterase II  44.15 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  36.21 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  41.16 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  41.84 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  39.86 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  46.34 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  42.46 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  38.95 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  39.66 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  39.58 
 
 		 286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  40.79 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  38.95 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  40.43 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  38.65 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  40.5 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  40.79 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  43.46 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  40.56 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  39.31 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  39.37 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  37.81 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  39.08 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  38.1 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  37.86 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  38.55 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  38.55 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  39.43 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  39.93 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  38.55 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  38.71 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  38.21 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  38.38 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  40.35 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  40.07 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  38.21 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  41.96 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  39.08 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  37.86 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  41.24 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  40.7 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  37.82 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>