200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4093 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  75 
 
 
264 aa  384  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4850  acyl-CoA thioesterase  65.5 
 
 
272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4938  acyl-CoA thioesterase  65.5 
 
 
272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436954  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5217  acyl-CoA thioesterase  65.12 
 
 
272 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709818  hitchhiker  0.00988837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1008  acyl-CoA thioesterase  50.97 
 
 
283 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473506  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  47.23 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2592  Choloyl-CoA hydrolase  43.53 
 
 
274 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0205084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  37.36 
 
 
291 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  37.23 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  36.88 
 
 
294 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  37.93 
 
 
281 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  37.26 
 
 
294 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  36.47 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  38.96 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  36.51 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  36.9 
 
 
286 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  35.86 
 
 
286 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  34.8 
 
 
277 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  36.76 
 
 
301 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  35.55 
 
 
286 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  37.1 
 
 
318 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  35.32 
 
 
287 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  37.65 
 
 
285 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  36.51 
 
 
291 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  38.25 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0166  palmitoyl-CoA hydrolase  37.8 
 
 
297 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00441126  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  35.74 
 
 
282 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  37.4 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  37.09 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  35.41 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  35.57 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  37.3 
 
 
286 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  35.52 
 
 
282 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2001  palmitoyl-CoA hydrolase  37.85 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.657953  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  36.61 
 
 
287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  36.15 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  35.32 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  35.46 
 
 
296 aa  131  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  34.31 
 
 
301 aa  131  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  36.4 
 
 
306 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2249  acyl-CoA thioesterase II  35.53 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2296  acyl-CoA thioesterase II  35.53 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2288  acyl-CoA thioesterase II  35.53 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  33.73 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  34.94 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  34.92 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  36.65 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  34.9 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  35.86 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  34.88 
 
 
289 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4196  acyl-CoA thioesterase  43.1 
 
 
324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  35.69 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  35.83 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  35.83 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  35.83 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  34.08 
 
 
300 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  35.83 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  35.83 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  34.72 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  35.61 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  35.86 
 
 
293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  36.47 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  34.57 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
287 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  37.01 
 
 
295 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  37.45 
 
 
274 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  35.71 
 
 
289 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  33.99 
 
 
294 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  34.92 
 
 
287 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  35.32 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  34.51 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  34.51 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  35.55 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
286 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
286 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  36.47 
 
 
286 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
286 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
286 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
286 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  39.06 
 
 
296 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
286 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  36.47 
 
 
286 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  37.11 
 
 
288 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  33.98 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
292 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  34.12 
 
 
289 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  34.92 
 
 
288 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  34.94 
 
 
284 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  34.92 
 
 
288 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  33.1 
 
 
281 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  34.51 
 
 
288 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  32.12 
 
 
326 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  35.52 
 
 
286 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  34.92 
 
 
288 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  35.52 
 
 
286 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>