88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02424 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  100 
 
 
271 aa  568  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  56.09 
 
 
270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  41.11 
 
 
284 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  40.65 
 
 
264 aa  208  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  39.6 
 
 
265 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  39.2 
 
 
265 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  40.73 
 
 
265 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  38 
 
 
271 aa  204  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  38.8 
 
 
265 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  38.62 
 
 
265 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  39.52 
 
 
265 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  38.71 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  28.52 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  27.49 
 
 
261 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  25.37 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  25.91 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  28.74 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  24.03 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  23.66 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  24.58 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  24.57 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  24.22 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  30.36 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  22.58 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  25.18 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  22.69 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  30 
 
 
289 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  22.31 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  24.24 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  24.24 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  23.48 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  35.56 
 
 
287 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  23.48 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  23.48 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  24.06 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  25.29 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  23.79 
 
 
291 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  34.15 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  22.92 
 
 
300 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  25.1 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  29.06 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  24.91 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  21.03 
 
 
293 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  22.61 
 
 
287 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 
288 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  35.06 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  24.91 
 
 
293 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  23.4 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  21.79 
 
 
288 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  22.44 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  21.79 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  21.79 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  29.63 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  32.43 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  23.95 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  22.41 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  31.08 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  23.6 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0306  acyl-CoA thioesterase  26.53 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  21.25 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  23.39 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  21.34 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  24.54 
 
 
311 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1097  acyl-CoA thioesterase  24.65 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.157874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  23 
 
 
300 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  21.72 
 
 
269 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  22.61 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  24.07 
 
 
269 aa  42.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>