35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  56.02 
 
 
288 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  55.3 
 
 
269 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  53.01 
 
 
272 aa  285  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  54.34 
 
 
269 aa  284  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  55.85 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  52.19 
 
 
280 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  51.45 
 
 
280 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  51.45 
 
 
280 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  49.1 
 
 
283 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  51.06 
 
 
294 aa  251  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  48.59 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  48.31 
 
 
274 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  52.01 
 
 
276 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  52.27 
 
 
272 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  48.9 
 
 
277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  44.24 
 
 
273 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  41.39 
 
 
277 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  40.93 
 
 
386 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  41.39 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  31.78 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  27.5 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.31 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  26.54 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  22.3 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  24.66 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  25.29 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  23.95 
 
 
265 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.98 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.39 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  25.28 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  24.79 
 
 
263 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  27.01 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>