35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5186 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  100 
 
 
300 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  28.16 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  28.28 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  25.36 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  30.09 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  25.84 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  27.37 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  28.98 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  23.72 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.5 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  27.57 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  26.69 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  24.73 
 
 
280 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  24.73 
 
 
280 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  26.09 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  25.82 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  26.55 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  26.32 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.77 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  26.43 
 
 
266 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  27.54 
 
 
267 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  22.92 
 
 
271 aa  48.9  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  22.35 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.9 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  24.83 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  28.45 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  24.4 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  24.3 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  25.78 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0306  acyl-CoA thioesterase  29.75 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  25.99 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  26.54 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  27.73 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  25.1 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  24.3 
 
 
265 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>