44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3419 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  36.72 
 
 
266 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  40.68 
 
 
261 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  39.08 
 
 
258 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  33.47 
 
 
282 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  32.13 
 
 
279 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  32.33 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  30.58 
 
 
270 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  30.2 
 
 
284 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  33.33 
 
 
265 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  31.58 
 
 
265 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  31.98 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  31.97 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  31.56 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  31.56 
 
 
265 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  30.45 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  31.02 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  28.74 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  27.67 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  24.9 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  24.29 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  30.16 
 
 
270 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  26.51 
 
 
386 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  24.81 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  23.55 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  23.55 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  23.55 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  25.93 
 
 
288 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  23.74 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  24.91 
 
 
270 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  27.47 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  25.67 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  23.48 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  24.3 
 
 
269 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  27.38 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  25.42 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  22.51 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  24.11 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  26.4 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  24.24 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.74 
 
 
300 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  23.7 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  24.9 
 
 
282 aa  42  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  30 
 
 
264 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>