44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1740 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  530  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  60.69 
 
 
263 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  54.02 
 
 
270 aa  258  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  37.4 
 
 
264 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  39.77 
 
 
268 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  36.18 
 
 
263 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  31.6 
 
 
270 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  27.2 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  31.27 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  29.1 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  30.27 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  30.68 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.46 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  33.95 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  27.94 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  27.94 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  27.94 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  27.38 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  28.77 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  28.46 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  27.99 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  26.67 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  27.85 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  27.5 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  25.37 
 
 
288 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10534  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 
343 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152696  normal  0.163322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  25.1 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  24.29 
 
 
260 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  25.76 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  26.05 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  24.72 
 
 
323 aa  49.7  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  25.26 
 
 
258 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  26.95 
 
 
311 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00335  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78618]  22.18 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.628153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  24.79 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  28.31 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.35 
 
 
271 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  23.97 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  24.19 
 
 
244 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  24.9 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  25.18 
 
 
265 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>