26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0659 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  45.28 
 
 
311 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  39.07 
 
 
283 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  39.07 
 
 
283 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  39.07 
 
 
283 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  40.14 
 
 
291 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  37.55 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  40.54 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  34.41 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 
268 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  35.16 
 
 
266 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  33.73 
 
 
263 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  33.07 
 
 
264 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  34.62 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  27.88 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  30.3 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  30.8 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  28.46 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  29.55 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  26.64 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  27.31 
 
 
261 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
128 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>