25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4961 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  520  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  36.78 
 
 
263 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  34.75 
 
 
264 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  37.36 
 
 
274 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  36.19 
 
 
266 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  38.64 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  38.34 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  29.59 
 
 
271 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
268 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  30.08 
 
 
264 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  31.54 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  30.25 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  30.25 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  30.25 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  30.27 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  30.45 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  31.54 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  31.68 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  30.77 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  29.17 
 
 
291 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  28.8 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10534  conserved hypothetical protein  23.46 
 
 
343 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152696  normal  0.163322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  29.52 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  30.48 
 
 
272 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>