48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0296 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  31.56 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  30.86 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  31.32 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  30.52 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  29.85 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  28.52 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  28.62 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  27.2 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  30.08 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  28.85 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  32.03 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  27.88 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  25.82 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  24.36 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  25.87 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  23.47 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  23.47 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  26.57 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  23.47 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  23.02 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  23.67 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  22.99 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  22.3 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  25.24 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  24.64 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  21.79 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  23.97 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  25.1 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  22.35 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  22.61 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  23.58 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  19.03 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  21.79 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  21.79 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  21.48 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  22.64 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  21.13 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  20.73 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  23.68 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  25.19 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  24.6 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  20.44 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  23.13 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  21.74 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  20.07 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  22.43 
 
 		 265 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  27.59 
 
 		 258 aa  42  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>