26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4084 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  75.71 
 
 
280 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  75.71 
 
 
280 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  68.93 
 
 
280 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  60.7 
 
 
311 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  60.28 
 
 
283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  63.77 
 
 
276 aa  338  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  60.81 
 
 
277 aa  323  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  56.99 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  56.25 
 
 
272 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  51.06 
 
 
282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  48.91 
 
 
269 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  47.46 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  47.04 
 
 
269 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  47.79 
 
 
274 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  49.07 
 
 
272 aa  235  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  45.32 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  39.19 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  38.99 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  37.82 
 
 
386 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  27.97 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  25.94 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  21.48 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  26.61 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  26.36 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>