32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3273 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  56.02 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  55.3 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  53.58 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  45.56 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  46.89 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  45.09 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  43.82 
 
 		 272 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  44.24 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  45.99 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  45.99 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  44.13 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  42.81 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  44.78 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  44.65 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  42.54 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  44.94 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  42.96 
 
 		 386 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  41.85 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  40.74 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28.11 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  27.17 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.98 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  25.83 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  26.56 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  25.83 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  28.06 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  26.77 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  22.95 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  23.13 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  24.07 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.4 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>