30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0816 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  60.22 
 
 		 280 aa  336  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  64.36 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  64.36 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  60.81 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  59.12 
 
 		 276 aa  311  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  55.71 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  55.75 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  47.99 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  49.82 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  48.9 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  45.96 
 
 		 269 aa  241  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  44.6 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  45.29 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  43.48 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  45.96 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  40.43 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  41.79 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  38.27 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  26.17 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  23.38 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  25.11 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  26.14 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  25.93 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  29.14 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  24.48 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  23.1 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  24.43 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>