46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1148 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  45.8 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  44.94 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  44.74 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  40.53 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  43.13 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  39.92 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  44.36 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  38.64 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  38.61 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  31.56 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  34.56 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  32.53 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  32.53 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  32.53 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  32.13 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  33.21 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  31.82 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  36.2 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  31.08 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  34.62 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  31.6 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  24.54 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  25.09 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  27.57 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  25.82 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  26.41 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  22.71 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2907  acyl-CoA thioesterase  33.65 
 
 		 309 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121085  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  24.39 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.69 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  26.61 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.15 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  25.76 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  26.69 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  26.67 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  23.87 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  25.67 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  22.18 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  25.1 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00335  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78618]  24.64 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.628153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  26 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.6 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  24.18 
 
 		 265 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>