24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  544  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  50.55 
 
 
268 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  43.32 
 
 
283 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  43.32 
 
 
283 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  43.32 
 
 
283 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  44.74 
 
 
291 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  41.95 
 
 
270 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  41.37 
 
 
282 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  40.54 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  37.55 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  37.31 
 
 
263 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  38.22 
 
 
311 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  36.98 
 
 
266 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  38.22 
 
 
268 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  35.41 
 
 
270 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  37.36 
 
 
262 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  34.57 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  34.81 
 
 
270 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  31.02 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  31.27 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  32.03 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10534  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 
343 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152696  normal  0.163322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  27.18 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  24.42 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>