28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0824 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  44.32 
 
 
266 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  43.4 
 
 
264 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  41.6 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  43.12 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  38.11 
 
 
274 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  34.11 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  37.55 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  36.09 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  34.88 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  32.81 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  28.79 
 
 
264 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  32.28 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  33.46 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  32.65 
 
 
270 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  32.31 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  32.31 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  32.31 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  33.73 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  31.91 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  29.83 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  31.69 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  30.89 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  32.23 
 
 
282 aa  49.3  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  27.45 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  27.04 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  26.74 
 
 
299 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>