23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6744 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 268 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  51.66 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  36.27 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  37.5 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  35.9 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  36.3 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  36.3 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  36.3 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  38.49 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  37.36 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  36.94 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  35.61 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  37.21 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  36.92 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  34.85 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  32.01 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  34.2 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  32.25 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  29.26 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  26.94 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10534  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152696  normal  0.163322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>