30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2367 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  51.11 
 
 
266 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  44.32 
 
 
264 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  43.12 
 
 
263 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  33.83 
 
 
263 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  34.51 
 
 
270 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  34.55 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  29.59 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  31.02 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  30.32 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  28.62 
 
 
270 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  29.27 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  28.87 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  32.54 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  28.52 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  28.52 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  28.52 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  30.68 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  28.52 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  30.3 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  27.5 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  24.36 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10534  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152696  normal  0.163322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28.69 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 
152 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  25.93 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  24.44 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.3 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  24.73 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>