22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1002 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  614  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  45.28 
 
 		 276 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  39.93 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  39.93 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  39.86 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  39.47 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  38.01 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  37.91 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  38.22 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  34.31 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  35.25 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  34.36 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  33.21 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  31.3 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  28.52 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  33.95 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  44.9 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  29.47 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  25.87 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  36 
 
 		 265 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>