39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0190 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  77.15 
 
 		 272 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  56.02 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  56.99 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  54.64 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  52.63 
 
 		 311 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  53.99 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  53.99 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  49.64 
 
 		 283 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  53.45 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  50 
 
 		 269 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  51.31 
 
 		 274 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  49.62 
 
 		 269 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  49.82 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  45.56 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  49.81 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  45.22 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  45.59 
 
 		 277 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  43.68 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  44.69 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28.84 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  30.71 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  25.37 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  30.2 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  24.19 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  28.29 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  25.09 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  21.79 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.1 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  26.38 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  26.47 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  25.25 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  25.25 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  25.25 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  24.21 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  27.08 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  24.53 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  24.44 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>