39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3563 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  75.75 
 
 
269 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  56.02 
 
 
269 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  54.34 
 
 
282 aa  284  8e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  50.19 
 
 
272 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  50 
 
 
288 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  47.78 
 
 
276 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  45.32 
 
 
280 aa  251  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  46.81 
 
 
283 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  47.99 
 
 
277 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  46.69 
 
 
280 aa  244  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  46.69 
 
 
280 aa  244  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  46.3 
 
 
274 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  48.91 
 
 
294 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  47.99 
 
 
273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  45.45 
 
 
386 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  42.41 
 
 
311 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  44.85 
 
 
277 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  43.96 
 
 
272 aa  201  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  43.91 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  27.83 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  27.2 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.79 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  29.46 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  27.34 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  24.9 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.82 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  25.4 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  26.05 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  19.03 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.81 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.5 
 
 
264 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  26.97 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  24.39 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  24.7 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  25.2 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  21.72 
 
 
271 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  24.8 
 
 
265 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>