27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3933 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  59.52 
 
 		 283 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  60.42 
 
 		 280 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  62.46 
 
 		 280 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  62.46 
 
 		 280 aa  329  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  61.4 
 
 		 294 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  55.75 
 
 		 277 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  55.4 
 
 		 276 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  53.33 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  50.18 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  47.89 
 
 		 282 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  44.76 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  42.46 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  43.55 
 
 		 269 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  42.4 
 
 		 273 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  42.41 
 
 		 269 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  44.21 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  38.6 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  37.41 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  37.89 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  25.75 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  28.37 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  24.62 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  24.6 
 
 		 264 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  27.84 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  24.8 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  24.4 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>