39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0145 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  77.15 
 
 		 288 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  53.41 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  53.16 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  53.01 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  56.25 
 
 		 294 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  50.18 
 
 		 311 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  52.86 
 
 		 280 aa  271  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  52.86 
 
 		 280 aa  271  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  50.92 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  50.19 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  48.94 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  49.44 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  47.23 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  43.82 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  44.16 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  44.98 
 
 		 386 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  45.22 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  44.81 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  26.98 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  27.99 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  27.87 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  28.28 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  22.44 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  24.18 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.73 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  28.45 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.93 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  27.8 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  23.95 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  28.22 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  26.25 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  24.01 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  20.07 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  24.01 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  24.01 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  27.31 
 
 		 265 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10534  conserved hypothetical protein  23.64 
 
 		 343 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152696  normal  0.163322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>