117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4024 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  71.32 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  69.17 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  69.55 
 
 		 265 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  69.55 
 
 		 265 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  67.29 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  63.26 
 
 		 265 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  59.47 
 
 		 265 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  59.85 
 
 		 265 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  55.3 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  43.54 
 
 		 270 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  40.65 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  32.42 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  29.08 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  26.94 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  28.16 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  29.22 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  28.97 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  27.46 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  25.56 
 
 		 285 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  24.19 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  24.11 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  24.71 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  26.4 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  22.62 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  22.96 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  24.02 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  23.94 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  24.51 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  26.59 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  23.94 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  23.94 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  26.8 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  27.56 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  24.51 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  24.51 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  24.51 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  24.14 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  25.88 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  33.77 
 
 		 299 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  24.81 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  34.55 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  25.4 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  23.79 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  31.82 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  23.79 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  23.79 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  21.96 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  23.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  22.58 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  22.62 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  27.17 
 
 		 323 aa  49.7  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 		 292 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  24.62 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  25.53 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  25.93 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  24.29 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  23.79 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  21.46 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  25.2 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  24.1 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  35.14 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  27.18 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  25.5 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  37.84 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  24.21 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  25.59 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01959  Acyl-CoA thioesterase II  31.71 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000306387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  30.34 
 
 		 314 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  26.38 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  29.06 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  31.63 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  25.39 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  36.49 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  27.35 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  31.82 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  35.14 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  30.38 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>