32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4208 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  40.91 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  38.87 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  36.12 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  34 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  29.01 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  29.89 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  27.89 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  31.64 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.03 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  29.08 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  30.8 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  29.32 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  30 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  29.48 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  28.57 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  29.88 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  29.88 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  28.19 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  27.89 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  26.42 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28.08 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  28.4 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  28.51 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  26.61 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  27.24 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  27.13 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  25.93 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  24.68 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>