98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2057 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  68.18 
 
 		 271 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  63.26 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  58.87 
 
 		 265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  58.49 
 
 		 265 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  57.89 
 
 		 265 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  57.74 
 
 		 265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  56.6 
 
 		 265 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  55.85 
 
 		 265 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  50.57 
 
 		 284 aa  275  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  38.75 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  38.71 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  27.98 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  30.45 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  30.43 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  26.59 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  25 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  26.8 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  31.73 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  28.28 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  28.29 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  34.91 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.09 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  35.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  25.59 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  37.33 
 
 		 301 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  35 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  34.57 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  34.57 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  34.57 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  34.57 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  34.57 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  23.95 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  26.69 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  31.78 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  28.21 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  28.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  30.95 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  26.57 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  32.14 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  32.14 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  29.46 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  26.81 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  32.93 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  25.2 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  26.23 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  25.73 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  24.8 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  29.47 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  34.67 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  32.71 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  33.75 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  25.11 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  33 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  32 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  34.67 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  25.52 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  34.07 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  31.71 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  35.44 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  34.67 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  34.67 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01959  Acyl-CoA thioesterase II  28.09 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000306387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  26.52 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  34.67 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  24.71 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  35.06 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  30.09 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  27.83 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4938  acyl-CoA thioesterase  27.57 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4850  acyl-CoA thioesterase  27.57 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  29.27 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  25.3 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5217  acyl-CoA thioesterase  27.57 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709818  hitchhiker  0.00988837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  34.67 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  34.62 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  24.31 
 
 		 289 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  24.31 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  24.49 
 
 		 289 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  28.85 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>