26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1248 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  39.43 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  38.71 
 
 
265 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  36.82 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  32.37 
 
 
265 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  31.43 
 
 
265 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  32.74 
 
 
265 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  32.38 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  31.65 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  31.65 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  32.42 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  29.15 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  28.52 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  31.41 
 
 
260 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  32.71 
 
 
282 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  31.64 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  29.39 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  28.78 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  28.23 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  26.87 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  26.46 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  27.41 
 
 
274 aa  48.9  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  23.66 
 
 
244 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  26.59 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.54 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  32.46 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>