90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1910 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  96.23 
 
 		 265 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  95.09 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  90.57 
 
 		 265 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  69.55 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  63.53 
 
 		 271 aa  348  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  58.49 
 
 		 265 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  57.36 
 
 		 265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  56.6 
 
 		 265 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  49.81 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  38.62 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  30 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2656  hypothetical protein  30.86 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  30.33 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0760  hypothetical protein  29.6 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0974369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0871  hypothetical protein  27.89 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  26.54 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2250  acyl-CoA thioesterase  26.49 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4093  acyl-CoA thioesterase  24.91 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493541  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  24.12 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  21.86 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  30.8 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  23.41 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  22.27 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  22.27 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  26.71 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  22.82 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0306  acyl-CoA thioesterase  33.65 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  24.29 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  23.6 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  22.62 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  22.62 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5217  acyl-CoA thioesterase  25.52 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709818  hitchhiker  0.00988837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4938  acyl-CoA thioesterase  26.78 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  22.62 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4850  acyl-CoA thioesterase  26.78 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  22.62 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  22.62 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  23.23 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  24.7 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  29.17 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  23.46 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  24.19 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  22.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  27.05 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  31.33 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  20.24 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01959  Acyl-CoA thioesterase II  28.1 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000306387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  22.09 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  23.46 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  21.76 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  22 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  27.96 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  32.91 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  21.88 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  24.3 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  33.77 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  30.21 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  22.92 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  26.88 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  29.05 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  20.93 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  23.51 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  20.93 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  20.93 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  28.4 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0166  palmitoyl-CoA hydrolase  24.39 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00441126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  25.2 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1097  acyl-CoA thioesterase  26.61 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.157874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  27.96 
 
 		 301 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2001  palmitoyl-CoA hydrolase  27.72 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.657953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  22.31 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  28.57 
 
 		 289 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  28.57 
 
 		 289 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  22.43 
 
 		 264 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  28.57 
 
 		 289 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  28.57 
 
 		 289 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>