41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3358 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  75.75 
 
 
269 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  55.85 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  53.58 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  49.44 
 
 
272 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  49.62 
 
 
288 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  46.45 
 
 
283 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  48.15 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  44.48 
 
 
280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  45.59 
 
 
280 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  45.59 
 
 
280 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  45.96 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  47.41 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  47.46 
 
 
294 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  43.21 
 
 
311 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  45.66 
 
 
272 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  45.15 
 
 
273 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  43.01 
 
 
386 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  41.85 
 
 
277 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  41.64 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2935  TesB family acyl-CoA thioesterase  25.71 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0609285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  28.04 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  27.42 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  27.85 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  26.69 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  27.57 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  24.14 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  22.31 
 
 
271 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1750  acyl-CoA thioesterase II  26.09 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000016381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1910  acyl-CoA thioesterase II  24.7 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  hitchhiker  0.00000276964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26960  hypothetical protein  25.2 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2308  acyl-CoA thioesterase II, putative  24.7 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214932  hitchhiker  0.000265117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2283  hypothetical protein  24.49 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3461  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.2 
 
 
265 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.985746  hitchhiker  0.000330564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  25.21 
 
 
268 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  28.22 
 
 
270 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2057  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.2 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0136597  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  20.73 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  25.81 
 
 
284 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  25.21 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  26.59 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>