32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7364 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  54.85 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  51.85 
 
 		 386 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  52.61 
 
 		 282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  45.62 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  45.22 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  47.99 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  44.16 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  44.78 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  42.4 
 
 		 311 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  43.64 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  45.32 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  45.15 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  44.24 
 
 		 282 aa  208  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  40.65 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  41.58 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  43.48 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  41.34 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  41.34 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  40.45 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  24.88 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.84 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  25.72 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  26.84 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  23.97 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  23.05 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  21.74 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  22.89 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  24.73 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  22.61 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>